بخش تحقیقات گیاهپزشکی در راستای وظایف محوله در زمینه شناسایی و مدیریت تلفیقی آفات، بیمارگرها و علفهای هرز در استان کرمان فعالیت می نماید. بدین منظور طرحها و پروژه های تحقیقاتی متفاوتی در این بخش در دست اجرا می باشد که تدوین این پروژه ها با توجه به نیازهای استان صورت می گیرد. از جمله عوامل موثر در مدیریت تلفیقی آفات استفاده از عوامل کنترل بیولوژیک است که در این زمینه نیز پروژه هایی به منظور شناسایی و بکار گیری شکارگرها ، حشرات پارازیت و پارازیتوئید، بیمارگرهای حشرات و عوامل کنترل کننده بیمارگرها و عوامل غیر شیمیایی نظیر فرمونها و مواد دور کننده و ... در دست اجرا می باشد تا با بکار گیری این عوامل گام مهمی در کاهش مصرف سموم، حفظ محیط زیست و سلامت جامعه برداشته شود. همچنین طرحهایی در خصوص بررسی باقیمانده سموم در خاک ، آب و محصولات کشاورزی در این بخش در دست اجرا می باشد.